加工中心的科学技术含量要比其他机床高，在操作控制上比其他机床复杂很多，必须严格按照操作规程操作才能保证机床安全运作。此外，加工中心的运行速度很快，需要在执行操作指令之前，预先判断操作指令的正确性和运行结果。然后再下操作指令，以尽最避免事故的发生。
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一、cnc加工中心工作之前的开机
1、接通机床总电源及CRT显示器电源.启动机床液压系统。
2、在CRT上检查机床有无各种报普信息及时排除苦报.检查机床外围设备是否正常。
3、检查机床换刀机械手及刀库位置是否正确。
4、检查机床各坐标是否处于安全位置，其中包括各坐标必须远离机床零点，以防止坐标回参考点时出现过冲现象并保证回参考点时刀具与加工工件不发生干涉。
5、各项坐标回参考点，一般情况下Z向坐标优先回零。使机床主轴上刀其远离加工工件同时观察各坐标运行是否正常。
6、检查主轴、机械手、刀库上的加工刀其有无异常情况。若刀库中刀具位置错、刀具出现破损等.应在开始加工前及时更换。
7、启动机床开始加工工件。
二、cnc加工中心关机
1、停止运行加工程序，记录加工中心所执行的加工程序的当前P段。
2、将主轴上的刀具移开加工工件，如果有必要，将机械手上抓的刀具还回刀库。
3、将机床各坐标移开机床零点并开到安全位置，以备下次开机时回参考点。
4、将手动进给修调和快速进给修调开关拨到零位，防止因误操作而使机床运动。
5、切断机床液压、压缩空气等。
6、切断机床CRT显示器电源。
7、切断机床总电源.做好交接班记录。
三、机床自动加工
机床自动加工也称为存储器方式加工。它是利用加工中心内存储的加工程序，使机床对工件进行连续加工，是加工中心运用得最多的操作方式。加工中心在存储器方式下运行时间越长.其机球利用率也就越高。卧式柔性单元为例，先在编辑状态下选择好加工程序，将“工作方式选择开关”拨到存储器方式，检索加工程序(选择加工程序起点)按“循环启动按钮”，机床就进人自动加工状态。